项目5

分子洞察二恶英降解微生物和微生物群落

微生物世界是巨大的不同,由于其3.7十亿年的进化,这对于尚未发现这两种代谢能力,包括对机会提供了污染物的降解,和检测,回收和表征ESTA活动的挑战。而微生物接触过小,由于事件二恶英自然经过上千年的金额:如森林火灾,它只是在上个世纪左右的二恶英,已成为自然界中丰富的食物来源,由于人类活动。 ESTA可以解释为什么有的只是表征能力矿化二恶英几个很好的微生物菌株。  

我们建议表征在纯培养和微生物群落二恶英的微生物响应了解有关危险ESTA类化合物的环境解毒的局限性。 

我们的长期目标是发展为微生物降解增强,分子标记鉴定中,以帮助识别现场评估,并制定模型在污染场地的生物降解预测。  

我们的具体目标是在这个项目有:

  1. 阐明生理学,生物化学,和氯化二恶英降解的遗传学为了理解和改进这些高度有毒污染物的修复
  2. 为了评估(元)全基因组反应和响应氯化二恶英包括那些从重要的环境进行地质吸附剂和微生物活性微生物群落的研究physiogenomic代谢能力
  3. 探索和恢复催化性质的多样性随着开发的降解和/或氯化二恶英和矿化微生物群落的代谢功能,全面的配置文件的目标二恶英类环境中的化合物

我们建议使用来富集帮助识别功能活性种群,因此基因,使用稳定同位素的探测,以从活性降解种群回收DNA,以使用宏基因组和metatranscriptomic文库和靶DNA的大规模并行RNA诱饵捕获的新颖技术和RNA收回全部基因和操纵子,使用此信息了解二恶英降解的生物化学和使用模型二恶英降解菌的转录和生物化学分析,以了解机体的参与在降解各种压力总体响应过程(即衬底和代谢物的毒性,代谢通量,等等)。